I materiali ceramici rinvenuti in varie occasioni presso il sito di San Tomè si collocano cronologicamente alla fine del IV millennio a.C, quando in Italia settentrionale sono attivi gli aspetti finali della Cultura dei Vasi a Bocca Quadrata con lo stile "a incisioni e impressioni" insieme ad elementi di emanazione Chassey-Lagozza. Sono infatti tipologicamente riferibili alla Cultura dei Vasi a Bocca Quadrata il frammento di orlo con decorazione a zig zag e quello di parete decorato da impressioni digitali trascinate; alla Cultura Chassey-Lagozza è invece ascrivibile l'ansetta tubolare. Rispetto ai momenti precedenti della Cultura dei Vasi a Bocca Quadrata, l'area di diffusione della terza fase sembra ridursi alla sola Lombardia orientale, al Trentino, al Veneto e al Friuli occidentale e documenta il graduale disgregarsi di una compagine che per quasi un millennio si era presentata omogenea.